Rodrigo Flores de Aldana (1625 - 1675?) fue un funcionario real español al servicio de Felipe IV, Caballero de la Orden de Alcántara y Comendador de las Casas de Coria. Actuó como en 1663 y fue designado por el rey gobernador de Yucatán en 1664. Habría de ser el último gobernador de la Capitanía General de Yucatán nombrado por Felipe IV, quien murió en septiembre de 1665.