Manuel III Comneno (16 de diciembre de 1364 - 5 de marzo de 1417) fue emperador de Trebisonda desde el 20 de marzo de 1390 hasta su muerte en 1417. Nació en el año 1364 y sucedió a su padre Alejo III de Trebisonda en 1390. Durante su reinado, el imperio se convirtió en un estado vasallo de los mongoles. Murió en 1417. También se le conoció como Manuel porfirogeneta.