La ruta endógena fundamentalmente se encarga de reenviar los lípidos desde el hígado hacia los tejidos cuando se necesita movilizar parte de las grasas o el colesterol, o cuando se necesita enviar los lípidos a las zonas de reserva. La ruta empieza en el hígado donde existen lípidos libres o recién sintetizados, ya sea por la descarga de los quilomicrones o por la neoformación de ácidos grasos.
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