Las rubredoxinas son una clase de proteínas de bajo peso molecular que contienen hierro y se encuentran en bacterias y arqueas que metabolizan azufre. A veces son clasificadas como proteínas hierro-azufre, sin embargo no contienen azufre inorgánico. Como los citocromos, ferredoxinas y proteínas de Rieske, las rubredoxinas participan en la transferencia de electrones en los sistemas biológicos.
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