La Primera División de Montenegro 2006/07 fue la primera edición que se llevó a cabo de este campeonato tras la separación de Serbia y Montenegro. La temporada comenzó el 12 de agosto de 2006 y finalizó el 26 de mayo de 2007. El Fudbalski Klub Zeta se proclamó campeón y se hizo así con el primer trofeo de la nueva liga.