La pandemia de gripe A (H1N1), que se inició en 2009, entró en Guatemala el 5 de mayo del mismo año. Éste fue el 7 país en reportar casos de gripe A en el continente americano. La primera persona infectada por esta pandemia fue una niña de la Ciudad de Guatemala, que fue detectada por el cordón sanitario ubicado en el Aeropuerto Internacional La Aurora.