Otto Nägeli fue un médico, hematólogo botánico suizo. Junto con Oskar Nägeli eran hijos del médico Otto Nägeli (1843-1922); y sobrinos del botánico Carl Wilhelm von Nägeli (1817-1891). Estudió en Lausanna, Zúrich, Estrasburgo, y en Berna. En 1897, recibió su doctorado en Zúrich, donde fue habilitado para la medicina interna en 1900. Fue profesor de medicina en Tubinga, Alemania y luego ordinarius y director de Clínica médica de la Universidad de Zúrich, en 1918.