El metaboloma es el conjunto completo de las pequeñas moléculas denominadas metabolitos que se pueden encontrar en una muestra biológica, tal como un organismo. El vocablo se acuñó en analogía con transcriptómica y proteómica. Como el transcriptoma y el proteoma, el metaboloma es dinámico, y cambia segundo a segundo. Aunque el metabaloma puede definirse de forma bastante sencilla, actualmente no es posible analizar el rango completo de metabolitos mediante un único método analítico.

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