El Haplogrupo L5 es un antiguo haplogrupo mitocondrial originario del África Oriental, probablemente en Etiopía. Fue denominado anteriormente L1e y se encuentra especialmente en el África Oriental y en los pigmeos mbuti. L5 es descendiente del haplogrupo L2-6, tiene una antigüedad aproximada entre 114.000 y 126.000 años y está definido por las mutaciones 459.1C, 3423, 7972, 12432, 12950, 16148 y 16166.
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