Los genes homeobox tienen una secuencia en común de 183 nucleótidos que codifican para proteínas nucleares especificas que actúan como factores de transcripción. También codifican para el dominio amino ácido 61, que es el homeodominio responsable para el reconocimiento y unión de secuencias especificas de DNA. La especificidad de esta unión permite que las homeoproteínas se activen o inhiban la expresión para lo sitios de unión de genes corriente abajo del promotor.
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