Francisco de Fernando de Médici fue el cuarto hijo del gran duque de Toscana Fernando I de Médici y de Cristina de Lorena. Destinado a la carrera diplomática, él en cambio prefirió seguir la militar. Estuvo al mando de las tropas enviadas por Toscana en 1613 en ayuda de Fernando Gonzaga contra el duque Carlos Manuel I de Saboya, pero no llegó a entrar nunca en acción porque entre los dos contendientes fue estipulada una paz antes de que él llegase al Ducado de Mantua.