El apeadero de Loja-San Francisco (antes conocida como San Francisco de Loja) es un apeadero de ferrocarril situado en Loja, Granada. Actualmente es la única parada de viajeros de la localidad, ya que la estación de Loja, situada a las afueras de la ciudad y a 2km en dirección a Granada, no tiene servicio de viajeros. Este apeadero es una parada de los servicios de Media Distancia Algeciras-Granada y Sevilla-Almería de Renfe Operadora.