En Botánica, el endocarpio o endocarpo es la capa más interior del pericarpio, es decir la parte del fruto que rodea a las semillas. En las bayas, como el arándano o la grosella, el endocarpio es muy blando y contiene multitud de pequeñas semillas. En los hesperidios, como las naranjas y limones el endocarpio son gajos jugosos que contienen las pepitas y es la única parte consumida, pues el mesocarpio cítrico es una fibra blanca.
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