Emilio Calleja Isasi (1830 - Guarnizo, Cantabria, 7 de septiembre de 1906), fue un militar español. Desde muy joven sirvió en la marina española. Cuando Santo Domingo se reintegró a los dominios españoles participó como comandante en las campañas de pacificacion de la isla, por cuyo desempeño fue distinguido como segundo al mando del batallón de infantería de marina.