La Diócesis de San Carlos de Bariloche es sufragánea de la Arquidiócesis de Bahía Blanca, por lo cual forma parte de la Provincia Eclesiástica de Bahía Blanca, junto con la mencionada Arquidiócesis, la Diócesis de Comodoro Rivadavia, la Diócesis de Río Gallegos, la Diócesis de Alto Valle del Río Negro, la Diócesis de Santa Rosa y la Diócesis de Viedma. Comprende en la provincia de Río Negro los departamentos de San Carlos de Bariloche, Ñorquinco, Pilcaniyeu, 25 de Mayo y 9 de Julio.