La diócesis de Goya es sufragánea de la Arquidiócesis de Corrientes, por lo cual forma parte de la provincia eclesiástica de Corrientes, junto con la mencionada arquidiócesis, la diócesis de Posadas, la diócesis de Puerto Iguazú, la diócesis de Santo Tomé y la nueva Diócesis de Oberá. Comprende, en la provincia de Corrientes, los departamentos de Curuzú Cuatiá, Esquina, Goya, Lavalle, Mercedes, Monte Caseros y Sauce.