Archamoebae es un grupo de Amoebozoa que se caracteriza por la ausencia de mitocondrias. Dos de los géneros, Entamoeba y Endolimax son parásitos o comensales internos de los animales. Algunas especies son patógenas para los seres humanos, causando enfermedades tales como la disentería amébica. Los otros géneros de archamoebae viven en hábitats de agua dulce y son inusuales entre las amebas por los flagelos que poseen.
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