Aquifex es un género de bacterias, uno de los pocos en el filo Aquificae. Las dos especies generalmente clasificadas en Aquifex son A. pyrophilus y A. aeolicus. Ambas son altamente termófilas, creciendo mejor en temperaturas acuáticas de 85 a 95 C. Crecen a menudo cerca de los volcanes subacuáticos o fuentes hidrotermales. A. aeolicus fue descubierto en el norte de Sicilia, mientras que A. pyrophilus fue primero encontrado en el norte de Islandia.
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