El Alkhurma virus es un miembro de la familia de virus Flaviviridae (clase IV), y por ello su material genético está formado por una cadena sencilla de ARNm de sentido (+). Se ha visto que es una variante del Kyasanur Forest disease virus (KFDV), puesto que comparte un 89% de homología en la secuencia de nucleótidos. El genoma vírico es capaz de confundirse con el ARNm de las células hospedadoras y la maquinaria necesaria para su propia expresión génica.
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